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11月13日，东京大学公布了针对教职员第二次质询的书面答复，首次披露了9月28日选考会议否决校内投票第一候选人的具体理由。
围绕东京大学首位女校长遴选程序的争议，由此从校内延伸至文部科学省，成为日本国立大学治理与说明责任边界的一次公开检验。
在事前实施的校内意向投票中，东京大学执行役·副校长 染谷隆夫 获得1107票，位列第一；
研究生院综合文化研究科教授 藤垣裕子 获得553票，约为前者半数。
9月28日，选考会议最终选择藤垣裕子为下任校长。
藤垣现年64岁，专业为科学技术社会论与科学计量学，曾任东京大学理事及副校长等职务，预计于2027年4月就任，将成为东京大学建校以来首位女性校长。
校方11月13日的答复首次系统披露了选考会议的评估逻辑。
对于染谷隆夫，答复称选考会议虽不否认其在“研究力、业绩与得票数上的优势”，但认为其在“ 治理与风险管理方面的积极性与应对方式 ”以及“ 对改革必要性的认识 ”上存在课题。
对于藤垣裕子，选考会议则积极评价其在“研究活动牵引力”“改革认识与大胆执行力”等四个维度上的表现，并特别指出她具备“ 通过学内外对话推动合意形成来运营大学的能力 ”。
最终投票中，除议长外15名委员有14人赞成藤垣当选。
染谷隆夫现年58岁，为东京大学工学系研究科教授，专业为半导体工程与有机电子学，2023年起出任执行役·副校长，分管产学协创与初创企业事务。
选考会议将“治理与风险管理”置于研究业绩与投票结果之上的判断，有其具体的制度语境。
2026年，东京大学相关法人“综合研究奖励会”曝出前事务局长在2016年至2026年间挪用约9000万日元（约合人民币376万元）资金的案件，该法人已决定在2026年度末解散。
此前，东京大学还接连发生医学院教师涉嫌受贿被捕等丑闻。
在这一背景下，选考会议的选择传递出一个清晰的信号：在治理信任受损之后，大学所需要的校长，首先是一位能够修复治理结构的管理者。
文科省的罕见介入 争议的第二个层面，在文部科学大臣 关芳弘 11月13日的表态后进一步凸显。
关芳弘在阁僚会议后记者会上明确表示，选考会议“有必要公开会议记录”，“从履行说明责任的角度出发，希望采取适当应对”。
他援引2024年修订的《国立大学法人治理准则》，指出选考过程与理由“应尽可能具体地公布，以确保可信度与透明度”。
据共同社报道，文部科学省就大学校长选拔要求校方进行验证“尚属首次”。
10月20日，文部科学省已以“校内外诸多质疑”为由要求东大对选拔过程进行验证；
高等教育局长合田哲雄亲赴东大递交文件，明确指出“基于社会责任，回应校内外的质疑，就此次校长选拔尽到说明责任，对于推进治理改革至关重要”。
东大此前的答复曾表示，投票结果“是重要的判断依据之一”，但“各委员在比较其他判断依据时多大程度上将其反映到评价之中则因人而异”。
这一表述指向了透明度问题的核心：当选考会议以“治理能力”这一难以量化的标准覆盖了近一倍票差的投票结果时，如果不公开审议记录，外部便无从判断这一覆盖是基于充分的事实与推理。
东大方面表示正在考虑公布会议的 要旨 ，但 不会公开个别委员的具体发言内容 。
这意味着，选考会议推翻校内投票结果的内部推理过程，其可被外部检验的程度仍然有限。
特别
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